“顺其自然，为所当为”是森田疗法的精髓所在，而如何正确地理解”顺其自然”这四个字则是治疗是否有效的前提条件。
在现实生活中，很多患者对”顺其自然”的理解都是不够深的或是错误的，因而造成森田疗法对他们的治疗毫无效果，甚至使他们对森田疗法本身是否有效都产生了怀疑。究其原因，其实是他们只是从字面上去理解其含义，以为”顺其自然”就”任其自然”，就是对自己的问题不加控制，痛苦就让其自己痛苦下去。如强迫观念的患者，他可能就会错误的认为”顺其自然”就是让自己一直强迫下去。
要正确地理解”顺其自然”，首先要弄明白什么是”自然”，这里的自然当然指”自然规律”。比如白天与黑夜的轮回、天气有晴也有阴，这些都是大自然的规律，它是不能人为控制的，人必须遵循、接受这些规律才会过得快乐。倘若人整天都抱怨为什么会有黑夜，或者认为阴天下雨是不应该的，那么就违背的”自然规律”，结果肯定是自找苦吃。
而我们人本身也是存在一定的自然规律的，比如情绪，它就是不能人为控制的，它本身有一套从发生到消退的程序。你接受它，遵循它，它很快就会走完自己的程序而结束。举例来说，比如你马上要参加一个重要的考试，这时你感到焦虑、紧张，其实这是非常正常的心理反应，如果你不去管你的情绪，它很快就会消失或者转化为你努力复习的动力，而倘若你认为自己不应该出现紧张或焦虑，那么你就违背情绪的”自然规律”，焦虑、紧张就会越来越严重。又比如说一个社交恐怖症的患者，性格内向，他和陌生人说话时感到紧张和不自在。他觉得不应该如此，非要在和陌生人面前故意表现得不紧张，其结果是他越来越紧张，以至于到现在看到熟人也开始紧张了。他之所以会发展到现在的这种症状，其原因是他违背他自己的”自然规律”。他的性格是内向的，而内向的人的特点就是腼腆和害羞，和陌生人谈话，肯定会出现紧张、不自在的心理反应的。而他自己却不接受自己的”自然规律”，和”自然规律”对抗，结果必然会如此。
人本身还有一个自然的现象，有时一些古怪的、可怕的、肮脏的、无聊的念头是必然会出现的，在这里可以暂且把它们称做杂念或者浮想，而杂念也和情绪一样，它也有自己的的一套从发生、发展到消失的过程。倘若你接受它存在，并知道它是毫无意义的”杂念”，不理会它，那么它将不会影响你，很快就消失了。反之，你去注意它，试图控制它，赶跑它，去和它辩论等，那么你就会被它束缚。例如一个品学兼优的学生，上课的时候，他的头脑里突然出现了一个杂念——我要把这个老师打了。这个念头使他非常的害怕，他觉得自己不应该出现这样的念头，他觉得自己太可怕了，所以就不停地自责和想为什么自己会出现这样的想法，从而对这一念头形成了强迫。这个学生之所以会出现这个念头，其原因其实很简单，就是因为这为这个老师平时对学习要求非常严格，以至于给学生造成了很大的心理压力。这个念头的出现其实就是这个学生对压力的一种发泄。在这里，让学生本身明白其观念是不太现实的，但倘若这个学生事前就明白杂念是必然会出现的道理，那么他有可能就不会那么在意这个杂念了，从而避免强迫观念的形成。
正确的”顺其自然”，就是在认识的”自然”的前提上，不去在意那些有”自然规律”的情绪或杂念。比如我们把平静的湖水比做是我们的思想，而把向湖水里投石所引起的涟漪比喻成影响我们情绪或杂念。那么你说我们要怎么样才能制止涟漪不断的产生呢？是继续向湖水投石头还是根本不用去管它能制止涟漪呢？答案当然是不再投石，根本不去管它。这根本就不用去管它就是”顺其自然”。当然为了能让”顺其自然”对你的问题产生效果，就得结合”为所当为”。也就是说，你在”顺其自然”的同时，你得把自己的注意力放在客观的现实中，该工作就去做工作，该学习就去学习，该聊天就去聊天。做自己应该去做的事情。当然也许刚开始的时候，那些困惑你的观念、杂念仍旧让你感到痛苦，但只要你相信它们是迟早会自然地消失的，并努力地去做好现实生活中你该去做的事情。那么，那些杂念、情绪就会在你认真做事的过程中不知不觉地消失了。
森田认为，要达到治疗目的，说理是徒劳的。正如从道理上认识到没有鬼，但夜间走过坟地时照样感到恐惧一样，单靠理智上的理解是不行的，只有在感情上实际体验到才能有所改变。而人的感情变化有它的规律，注意越集中，情感越加强；顺其自然不予理睬，反而逐渐消退；在同一感觉下习惯了，情感即变得迟钝；对患者的苦闷、烦恼情绪不加劝慰，任其发展到顶点，也就不再感到苦闷烦恼了。因此，要求患者对症状首先要承认现实，不必强求改变，要顺其自然，认识情感活动的规律，接受情感，不去压抑和排斥它，让其自生自灭，并通过自己的不断努力，培养积极健康的情感体验。
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